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FS-201飛測多通道免疫熒光干式定量檢測儀的熒光免疫檢測技術具有專一性強、靈敏度高、實用性好等優點，因此它被用于測量含量很低的生物活性化合物，例如蛋白質（酶、接受體、抗體）、激素（甾族化合物、甲狀腺激素、酞激素）、藥物及微生物等。作為免疫分析法的一種，FIA同樣存在兩種模式，即競爭型和夾心型。其中競爭型（以標記抗原的競爭型為例）的測定原理是基于未標記的抗原（Ag）和標記抗原（Ag-L）競爭結合有限的抗體（Ab）而實現的免疫分析法。FS-201飛測多通道免疫熒光干式定量檢測儀檢測時，Ab和Ag-L的濃度是固定的。當未標記的Ag加到Ab和Ag-L的免疫混合物中后，Ag和Ab的結合使得Ag-L與Ab的免疫復合物的量減少。樣品中存在的Ag越多，Ab結合的Ag-L便越少，從Ab-Ag-L免疫復合物的減少或游離Ag-L的增加，可以定量測定出樣品中待測抗原的含量。其反應過程如下：Ag+Ag-L+Ab≒（Ag：Ab）+（Ag-L：Ab）
對夾心型免疫分析來說，其反應原理是在免疫反應的載體上固定過量的Ab，然后加入一定量的Ag，免疫反應后，再加入過量的標記抗體（Ab-L），以形成“三明治”式夾心免疫復合物。樣品中存在的Ag越多，結合的Ab-L也越多，夾心免疫復合物的標記熒光信號就越強。反應過程如下：Ab+Ag≒Ab：Ag≒Ab：Ag：Ab-L。