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研究分享

今天分享一篇《LC-MS Orbitrap-based metabolomics using a novel hybrid zwitterionic hydrophilic interaction liquid chromatography and rigorous metabolite identification reveals doxorubicin-induced metabolic perturbations in breast cancer cells》于2025年在發表《RCS Advances》期刊上,探究了抗癌藥物阿霉素(多柔比星)對乳腺癌細胞造成的代謝紊亂的研究,并建立一套高效的代謝組學分析流程。

阿霉素(Doxorubicin)有“紅色魔鬼"之稱,又稱“多柔比星",屬于廣譜類的蒽環類抗腫瘤抗生素,它通過嵌入癌細胞的DNA雙鏈中,抑制調節DNA超螺旋結構的酶,阻止DNA復制和RNA轉錄,抑制腫瘤生長,從而發揮抗癌作用。阿霉素對多種惡性腫瘤都有治療作用,包括乳腺癌、肺癌、消化系統癌、卵巢癌、膀胱癌、肉瘤、淋巴癌及急性白血病。
Part.01
小分子代謝物的檢測難題
本研究基于代謝組學,利用高分辨率LC-MS、深度掃描數據依賴采集(DDA)以及包含990種標準的大型化學庫,精準捕捉到乳腺癌細胞在多柔比星作用下,最終鑒定出173種代謝物,其中26種代謝物和20條代謝途徑發生了顯著改變。解決了非靶向代謝組學中代謝物定性難、分離效果差的痛點。
生物體中的小分子代謝物(分子量通常<1500Da)往往濃度極低,甚至有很多關鍵差異代謝物含量遠低于質譜的檢測極限,并且這類代謝物容易發生降解,所以在樣品濃縮的過程中,如果處理不好可能會導致實驗失敗,一切歸零。
Part.02
解決方案
文章中使用Genevac S3i HT-12對阿霉素作用后的細胞粗提取物進行濃縮干燥,將目標代謝物濃縮至小體積或干燥粉末狀態,使代謝物濃度提升至檢測范圍內,讓原本信號微弱的微量代謝物,能夠被質譜儀精準識別。

Part.03
Genevac S3i HT-12溶劑蒸發工作站
Genevac 一直專注于研究與生產各種離心蒸發濃縮設備,Genevac S3i HT-12溶劑蒸發工作站是一款非常智能和大通量的濃縮儀,其通過真空+離心+溫和控溫的共同作用,滿足在代謝組學分析過程中對樣品高活性的要求。
那HT-12是如何在濃縮過程中保持樣品活性的呢"
1
真空 —— 低溫下的“蒸發加速器"
HT-12溶劑蒸發工作站通過抽真空,大大降低溶劑沸點,樣品在低溫度下就能快速蒸發,同時保護了那些對熱敏感的阿霉素代謝物,確保我們檢測到的代謝物真實反映了細胞的生理狀態 。

2
離心—— 樣品的“安全帶"
在真空環境下,低沸點溶劑非常容易暴沸,導致樣品飛濺。通過高速旋轉產生離心力,確保樣品在蒸發過程中始終集中在離心管底部,即使在高真空下也能平穩蒸發,避免樣品損失和交叉污染的風險 。

3
溫和控溫——精準的能量供給
SampleGuard™溫度控制技術能精準控制溫度,根據探測樣品實際溫度和轉子實際溫度,實時傳輸至工作站控制中心,溫度控制形成閉環,避免了過熱風險。實驗證實,經Genevac處理后的代謝物活性與標準品高度一致,降解問題得到有效控制。

4
實時溫度——蒸發過程可視化
系統實時顯示溫度、冷阱溫度、真空度、轉速等關鍵參數,蒸發全程可視化,實驗數據可追溯和導出,確保過程可控、結果可靠,保證非靶向代謝物樣品的完整性。

活動

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Genevac
ATS集團是德祥集團合作伙伴之一。英國Genevac公司成立于1990年,隸屬ATS SP Scientific旗下,一直專注于研究和生產各種離心蒸發濃縮設備,其產品廣泛應用于生命科學、制藥、化學、分析等領域。
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