10
當前位置：美谷分子儀器（上海）有限公司>>技術文章>>當“腸道菌群”遇上自動化：QPix FLEX 如何加速厭氧微生物篩選？
當“腸道菌群”遇上自動化：QPix FLEX 如何加速厭氧微生物篩選？
QPix FLEX 自動化微生物工作站在厭氧環境下實現：自動鋪板、高分辨率菌落識別、自動挑菌、液體培養轉移、MALDI-TOF 鑒定聯動并且全流程可追溯管理。
在近期腸道微生物組研究應用中，QPix FLEX 不僅實現了稀有共生菌及新型菌落形態（morphotypes）的成功回收，同時還顯著縮短了整體工作流程時間。研究人員的操作負擔得到大幅降低，實驗通量提升了一倍，從而支持針對微生物組樣本開展高分辨率分析，可應用于抗炎篩選、代謝通路表征以及活體生物治療制劑開發等領域。
為什么 QPix FLEX 值得關注？
更早發現目標菌落
傳統人工往往需要等到第 3–4 天才能穩定識別菌落。而 QPix FLEX 可基于：菌落大小、形態、邊緣、對比度、強度實現第 2 天提前篩選。
圖 1
如上圖圖 1所示，厭氧培養后，糞便樣本在血平板上生長形成菌落（右圖）。軟件已成功識別出可供挑取的離散克隆（左圖標注），但由于圖像對比度較低以及存在氣泡等表面偽影，人工識別受到明顯影響。
菌落客觀篩選與自動挑取改良
MRS 培養基上的菌落
圖 2
如上圖圖 2 所示，在改良 MRS 培養基上培養的菌落，基于 QPix FLEX 成像所得的直徑參數，被劃分為 8 個不同組別。每個組別對應特定的菌落尺寸范圍，從而能夠有針對性地篩選具有不同形態特征的克隆。系統隨后從每個組別中按照自動化篩選標準挑取 12 個菌落，確保在整個直徑分布范圍內均能夠獲得具有代表性的菌株。
MALDI-TOF 質譜結果
與目標菌株預期特征譜高度一致
QPix FLEX 在厭氧條件下分離獲得的菌株，其 MALDI-TOF 質譜結果與目標菌株預期特征譜高度一致，驗證了自動化挑菌流程的準確性，并證明該系統可兼容后續菌株鑒定與分析流程。
圖 3
一張圖告訴您 QPix FLEX
比手動流程強在哪兒？
糞便來源細菌厭氧培養工作流程對比：
圖 4
QPix FLEX 一體化工作站可無縫整合至厭氧培養流程，實現基于菌落形態的早期自動化篩選與高重復性挑菌。通過對菌落直徑進行分層篩選并結合多輪自動挑取，不僅擴大了可回收菌株的多樣性，還顯著減少了人工操作。結合 MALDI-TOF 質譜驗證，該方案能夠高效獲得具有明確表型特征的活菌克隆，從而加速微生物組研究及菌株開發流程。