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171285-25-9，5' Phosphorylating Amidite II可以作為底物，研究酶的活性
閱讀：64 發(fā)布時(shí)間：2025-10-24| 提 供 商 | 陜西新研博美生物科技有限公司 | 資料大小 | 44KB |
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化學(xué)性質(zhì)：
5' Phosphorylating Amidite II 是一種用于合成寡核苷酸的試劑，主要用于在寡核苷酸的5'末端引入磷酸基團(tuán)。
基本參數(shù)：
CAS：171285-25-9
中文名：5‘ 磷酸化亞磷酰胺 II
英文名：5' Phosphorylating Amidite II (O-DMT-2,2-di(ethoxycarbonyl)propan-1,3-diol)
分子式：C39H51N2O9P
分子量：722.80
規(guī)格標(biāo)準(zhǔn)：1mg、5mg、10mg
試劑廠家：陜西新研博美生物科技有限公司
合成條件：
稀釋：稀釋至100 μmol/mL。
偶聯(lián)時(shí)間：10分鐘偶聯(lián)。
脫保護(hù)條件：脫保護(hù)條件取決于使用的其他氨基磷酸酯類型。如果使用快速脫保護(hù)氨基磷酸酯，在60°C下用濃NH4OH處理1小時(shí)；如果使用標(biāo)準(zhǔn)氨基磷酸酯，在60°C下用濃NH4OH處理5小時(shí)。
相關(guān)應(yīng)用：
5'末端磷酸化：在寡核苷酸合成過程中，5' Phosphorylating Amidite II 可以在5'末端引入磷酸基團(tuán)。
DMT基團(tuán)的去除：DMT基團(tuán)可以在合成器上被去除，以確定偶聯(lián)效率，也可以保留用于反相柱純化。
純化方法：
反相柱純化：使用反相MicroPure柱（MP-1602）進(jìn)行純化。每個(gè)MicroPure柱可以處理1μmol合成柱的產(chǎn)物。
純化步驟：
用MeCN沖洗柱子（2 x 2 mL）。
用1N TEAA激活柱子（3 x 2 mL）。
加入粗DMT-寡核苷酸，1mL的1:1溶液（濃NH4OH/H2O）。收集并重新加載溶液兩次。
用3% NH4OH洗脫失敗產(chǎn)物（3 x 2 mL）。
用水沖洗柱子（3 x 2 mL）。
用2.5% TFA水溶液去除DMT（3 x 2 mL）。每次應(yīng)用之間等待5分鐘。
用水沖洗多余的TFA（3 x 2 mL；直到pH中性）。
插入收集管，用20% MeCN在水中洗脫純化的寡核苷酸（1 x 1.5 mL）。
在SpeedVac中干燥樣品。
為了產(chǎn)生5'磷酸，將沉淀物溶解在0.5 mL的濃NH4OH中。在60°C下保持30分鐘。
結(jié)構(gòu)式：
相關(guān)試劑產(chǎn)品：
5' Phosphate Amidite (O-DMT-2,2'-sulfonyldiethanol)
BHQ-1 Succinimidyl Ester
5' MMT-Amino C6 Modifier (MMT-6-Aminohexyl Amidite)
5' Phosphate Amidite (O-DMT-2,2'-sulfonyldiethanol)
Biotin Succinimdyl Ester
5' TFA-Amino C6 Modifier (TFA-6-Aminohexyl Amidite)
5' Biotin Amidite (N-DMT-Biotinyl-2-Aminoethoxyethanol)
DABCYL-C3-CPG (O-DMT-N-DABCYL-3-aminopropan-1,2-diol-Suc-CPG)
5' Thio C6 Modifier (Trityl-6-Thiohexyl Amidite)
5'-DMT-T-Suc-CPG
5' Thio C6 Modifier (Trityl-6-Thiohexyl Amidite)
CAL Fluor Orange 560 CPG (5'-DMT-T(C6-CAL Fluor Orange 560)-Glyc-CPG)
(5 and 6)-FAM, Mixed Isomers (5 and 6-CarboxyFluorescein-Aminohexyl Amidite)
TAMRA-Phos-CPG, 6-Carboxy Single Isomer (5'-DMT-mdC(TEG-TAMRA)-Phos-CPG)
C2 CPG (DMT-1,2-Etheyleneglycol-Suc-CPG)
5-FAM, Single Isomer (5-CarboxyFluorescein-Aminohexyl Amidite)
BHQ-10 Succinimidyl Ester
5’-DMT-T(C6 Amino)-Suc-CPG (5'-DMT-T(Hexyl-NH-TFA)-Suc-CPG)
DABCYL Amidite (N-DABCYL-6-Aminohexyl Amidite)
BHQ-2 Carboxylic Acid
DMT-Phosphate-CPG (O-DMT-2,2'-sulfonyldiethanol-Suc-CPG)
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