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Black Hole Quencher-1 dT Linker Amidite修飾的寡核苷酸可以用作探針
閱讀:36 發布時間:2025-10-29化學性質:
結構特點:其結構中含有BTQ-1染料基團以及脫氧胸苷連接臂和亞磷酰胺基團
基本參數:
中文名:BTQ-1 脫氧胸苷連接臂亞磷酰胺
英文名:BTQ-1 dT Linker Amidite,Black Hole Quencher-1 dT Linker Amidite
分子式:C74H89N12O14P
分子量:1401.54
規格標準:1mg、5mg、10mg
試劑廠家:陜西新研博美生物科技有限公司
合成方法:
BTQ-1 dT Linker Amidite的合成方法尚未在搜索結果中明確提及,但可以推測其合成過程可能涉及以下步驟:
BTQ-1染料的合成:通過特定的化學反應合成BTQ-1染料。
連接臂的合成:合成脫氧胸苷連接臂,可能涉及對脫氧胸苷的化學修飾。
亞磷酰胺基團的引入:通過化學反應將亞磷酰胺基團引入到BTQ-1染料和連接臂的結構中。
相關應用:
熒光探針合成
作為淬滅劑:BTQ-1 dT Linker Amidite 可用于在寡核苷酸的5'端或內部引入BTQ-1淬滅基團。該淬滅基團在480至580 nm范圍內具有最大吸收,能夠有效猝滅在此波長范圍內發射的熒光團。這種特性使其在熒光探針的構建中非常有用,例如在qPCR(定量聚合酶鏈反應)探針中,通過與熒光報告基團配對,實現對目標核酸的特異性檢測。
提高檢測靈敏度:在熒光探針中,BTQ-1作為淬滅劑可以有效降低背景熒光,提高信號與背景的比值,從而增強檢測的靈敏度。這在低豐度目標核酸的檢測中尤為重要,能夠幫助研究人員更準確地檢測到微量的目標物質。
寡核苷酸合成
提供連接臂:BTQ-1 dT Linker Amidite 中的dT連接臂結構,為寡核苷酸的合成提供了額外的靈活性。這種連接臂可以調整染料或標記物與寡核苷酸主鏈之間的空間位置,有助于優化探針的性能,例如減少空間位阻對雜交效率的影響。
構建復雜結構:在一些需要合成具有特定結構的寡核苷酸的應用中,如核酸適配體、核酸納米結構等,BTQ-1 dT Linker Amidite 可以作為構建模塊之一,用于引入特定的化學基團或功能結構。
生物醫學研究
基因檢測與診斷:在基因檢測領域,BTQ-1 dT Linker Amidite 修飾的寡核苷酸探針可用于檢測基因突變、基因表達水平等。例如,在癌癥的早期診斷中,通過檢測腫瘤相關基因的突變或異常表達,為疾病的診斷和治療提供依據。
藥物研發:在藥物研發過程中,該化合物可用于合成用于藥物篩選的核酸探針。通過檢測藥物與核酸之間的相互作用,評估藥物的靶向性和效果,為新藥的研發提供支持。
分子生物學研究
核酸雜交與測序:在核酸雜交實驗中,BTQ-1 dT Linker Amidite 修飾的寡核苷酸可以作為探針,用于檢測特定的核酸序列。在測序技術中,如新一代測序(NGS)和第三代測序技術,該化合物可用于合成測序引物或探針,提高測序的準確性和效率。
基因編輯技術:在基因編輯技術如CRISPR-Cas系統中,BTQ-1 dT Linker Amidite 可能用于合成引導RNA(gRNA)或修飾Cas蛋白,以提高基因編輯的效率和特異性。
注意事項:
稀釋與溶解:稀釋之前,請確保所有產品均在小瓶底部。稀釋至建議的濃度,并在密封的小瓶中充分混合,以確保所有固體均已溶解。
脫保護條件:脫保護條件取決于用于合成寡聚物的亞酰胺的類型。如果使用標準亞酰胺,則在60℃的濃NH4OH中脫保護5小時;如果使用快速脫保護劑,則在60℃的濃NH4OH中脫保護劑1小時。
保存條件:如果在合成過程中未使用所有溶液,則可將其保存在氬氣中,其功能最多可維持48小時。如果將BTQ-1酰胺放在露天或未干燥的地方,則易于氧化
結構式:

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