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TODi-3, far-red fluorescent nucleic acid stain屬于花菁二聚體染料
閱讀:25 發布時間:2026-6-18【Part 1:基礎知識】
英文名:TODi-3, far-red fluorescent nucleic acid stain
CAS:166196-17-4
分子式:C53H62I4N6S2
分子量:1354.85
供應商:陜西新研博美生物科技有限公司
【Part 2:理化性質】
外觀:藍色溶液。該產品以5 mM DMSO溶液形式供應。純度規格:經1H NMR和HPLC-MS檢測,純度≥95%。
溶解性:TODi-3為親脂性陽離子碳菁二聚體染料,以5 mM DMSO儲備液形式提供。推薦溶劑為DMSO,典型濃度為5 mM(儲備液)。該染料為細胞不可滲透性(cell-impermeant)核酸染色劑。
光譜數據:
激發波長(Ex) :644 nm(與DNA復合物)
發射波長(Em) :662 nm(與DNA復合物)
pH敏感性:
TODi-3的熒光發射依賴于與dsDNA的結合狀態而非溶液pH值。該染料在未與核酸結合時基本無熒光,與dsDNA結合后產生熒光增強。在常規實驗的pH范圍(pH 7.0–8.5)內,該染料的核酸結合性能和熒光穩定性良好,推薦使用pH 7.4的PBS、Tris-HCl或TE緩沖液進行染色實驗。該染料為細胞不可滲透性,僅能對細胞膜受損的細胞(如死細胞或固定透化后的細胞)的核酸進行染色,而無法進入完整的活細胞。TODi-3無細胞毒性,可用于培養物中細胞活力的長期監測和死細胞檢測。

【Part 3:相關應用】
應用1:微陣列芯片上的核酸染色與高靈敏度檢測
TODi-3因其明亮的遠紅色熒光信號和極低的背景熒光,成為微陣列(microarray)上核酸染色的理想選擇。在微陣列實驗中,靶標核酸(如cDNA、寡核苷酸)被固定在固體支持物上,TODi-3可與其特異性結合并產生良好的遠紅色熒光信號。
應用2:多色熒光標記實驗中的細胞核與染色體復染
TODi-3是一種細胞不可滲透的核酸染料,可用于細胞核和染色體的復染(counterstaining)。在固定透化后的細胞或組織切片中,TODi-3可穿透細胞膜并嵌入DNA雙鏈,發出明亮的遠紅色熒光。
應用3:死細胞指示與細胞活力長期監測
TODi-3為細胞不可滲透性核酸染色劑,可對細胞膜受損的細胞(如死細胞或經固定處理的細胞)進行特異性染色。
應用4:凝膠電泳中的核酸可視化檢測
TODi-3可用于瓊脂糖凝膠或聚丙烯酰胺凝膠中核酸的可視化檢測。在凝膠電泳實驗中,TODi-3與DNA或RNA結合后發出明亮的遠紅色熒光,可通過凝膠成像系統進行檢測。
【Part 4:同系列試劑】
TODi-1,綠色熒光核酸染色劑(TODi-1, green fluorescent nucleic acid stain / Thiazole Orange Homodimer / TOTO®-1),CAS: 143413-47-2
TODi-3,遠紅色熒光核酸染色劑(TODi-3, far-red fluorescent nucleic acid stain / Thiazole Red Homodimer / TOTO®-3),CAS: 166196-17-4
YODi-1,綠色熒光核酸染色劑(YODi-1, green fluorescent nucleic acid stain / Oxazole Orange Homodimer / YOYO®-1),CAS: 143413-48-3
YODi-3,紅色熒光核酸染色劑(YODi-3, red fluorescent nucleic acid stain / Oxazole Red Homodimer / YOYO®-3),CAS: 156312-20-8
PODi-1,藍色熒光核酸染色劑(PODi-1, blue fluorescent nucleic acid stain / POPO®-1),CAS: 157199-59-2
PODi-3,黃色熒光核酸染色劑(PODi-3, yellow fluorescent nucleic acid stain / POPO®-3),CAS: 154757-99-0
BODi-1,青色熒光核酸染色劑(BODi-1, cyan fluorescent nucleic acid stain / BOBO®-1),CAS: 166196-16-3
BODi-3,橙色熒光核酸染色劑(BODi-3, orange fluorescent nucleic acid stain / BOBO®-3)
TO-PRO-1碘化物(TO-PRO-1 Iodide,綠色熒光核酸染料),CAS: 157199-59-2
TO-PRO-3碘化物(TO-PRO-3 Iodide,遠紅色熒光核酸染料),CAS: 157199-60-5
YO-PRO-1碘化物(YO-PRO-1 Iodide,綠色熒光核酸染料),CAS: 152068-09-2
YO-PRO-3碘化物(YO-PRO-3 Iodide,紅色熒光核酸染料)
PO-PRO-1碘化物(PO-PRO-1 Iodide,藍色熒光核酸染料),CAS: 157199-58-1
BO-PRO-1碘化物(BO-PRO-1 Iodide,青色熒光核酸染料),CAS: 157199-57-0
BO-PRO-3碘化物(BO-PRO-3 Iodide,橙色熒光核酸染料),CAS: 173357-16-9
TO-TAP-3,遠紅色熒光核酸染色劑(TO-TAP-3, far-red fluorescent nucleic acid stain / TO-PRO®-3)
YO-TAP-1,綠色熒光核酸染色劑(YO-TAP-1, green fluorescent nucleic acid stain / YO-PRO®-1),CAS: 152068-09-2
YO-TAP-3,紅色熒光核酸染色劑(YO-TAP-3, red fluorescent nucleic acid stain / YO-PRO®-3)
PO-TAP-3,黃色熒光核酸染色劑(PO-TAP-3, yellow fluorescent nucleic acid stain)
TOTO-1碘化物(TOTO-1 Iodide,綠色熒光核酸染料),CAS: 143413-47-2
TOTO-3碘化物(TOTO-3 Iodide,遠紅色熒光核酸染料),CAS: 166196-17-4
YOYO-1碘化物(YOYO-1 Iodide,綠色熒光核酸染料),CAS: 143413-48-3
YOYO-3碘化物(YOYO-3 Iodide,紅色熒光核酸染料),CAS: 156312-20-8
POPO-1碘化物(POPO-1 Iodide,藍色熒光核酸染料),CAS: 157199-59-2
POPO-3碘化物(POPO-3 Iodide,黃色熒光核酸染料),CAS: 154757-99-0
BOBO-1碘化物(BOBO-1 Iodide,青色熒光核酸染料),CAS: 166196-16-3
BOBO-3碘化物(BOBO-3 Iodide,橙色熒光核酸染料)
【Part 5:注意事項】
反應條件建議(pH、溫度、時間):
儲備液配制:TODi-3以5 mM DMSO溶液形式供應。使用前應根據實驗需求用適宜的緩沖液(如PBS、Tris-HCl、TE緩沖液,pH 7.0–8.5)稀釋至工作濃度。建議現配現用,避免反復凍融。
染色條件:該染料為細胞不可滲透性,用于細胞核或染色體染色時,需先對樣品進行固定(如3.7%甲醛)和透化(如Triton X-100)處理,使染料能夠進入細胞并與核酸結合。染色通常在室溫(20–25°C)下進行,孵育時間一般為15–60分鐘,具體時間需根據樣品類型和染料濃度進行優化。對于死細胞檢測,無需固定和透化處理,染料可直接對細胞膜受損的死細胞核酸進行染色。
pH條件:推薦使用pH 7.0–8.5的緩沖液體系(如PBS、Tris-HCl、TE等),該染料在生理pH范圍內核酸結合性能和熒光穩定性最佳。
溫度條件:該產品應在-20°C避光條件下長期保存。運輸可在室溫條件下進行,最長不超過3周。建議儲存于干燥環境中(desiccate)。
避光儲存要求:
TODi-3對光敏感。應在-20°C避光、干燥條件下密封保存。建議儲存于帶干燥劑的密封容器中,避免反復凍融。取用時應避免長時間暴露于環境光線和空氣中,建議在暗處或低光照條件下操作。未使用完畢的儲備液應立即密封并返回-20°C保存。產品在正確儲存條件下有效期至少為24個月(自交付之日起)。
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