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C8-Alk-dT-CE-phosphoramidite是一種亞磷酰胺單體
閱讀：30 發(fā)布時間：2026-6-23【Part 1：基礎(chǔ)知識】
中文名：C8-炔基-dT-CE-亞磷酰胺
英文名：C8-Alkyne-dT-CE-phosphoramidite
CAS號：938186-76-6
分子式：C47H55N4O8P
分子量：834.95
供應(yīng)商：陜西新研博美生物科技有限公司
【Part 2：理化性質(zhì)】
外觀：
類白色至白色粉末。純度≥95%。
溶解性：
該試劑在二氯甲烷（DCM）、乙腈（Acetonitrile）和N,N-二甲基甲酰胺（DMF）中溶解性良好。推薦溶劑為無水乙腈（Anhydrous Acetonitrile），用于稀釋配制亞磷酰胺溶液。典型濃度為0.1 M（乙腈溶液），適用于標(biāo)準(zhǔn)核酸固相合成儀。該試劑對水分高度敏感，所有配制和操作均需在嚴(yán)格無水條件下進(jìn)行。
光譜數(shù)據(jù)：
C8-Alkyne-dT-CE-phosphoramidite本身不是熒光團，其分子結(jié)構(gòu)中的C8位炔基（alkyne）官能團在紫外-可見區(qū)域無特征熒光發(fā)射。該試劑作為核酸固相合成的功能化單體使用，通過標(biāo)準(zhǔn)亞磷酰胺化學(xué)將炔基修飾的核苷酸引入DNA鏈中。引入的炔基可通過銅催化的疊氮-炔環(huán)加成（CuAAC）點擊化學(xué)反應(yīng)與含疊氮基團的熒光染料、生物素或其他標(biāo)記物偶聯(lián)，從而實現(xiàn)熒光信號的引入。鑒于該化合物本身不具備熒光特性，常規(guī)文獻(xiàn)中不提供其激發(fā)波長、發(fā)射波長及消光系數(shù)參數(shù)。
pH敏感性：
該試劑對pH和水分高度敏感。亞磷酰胺基團在酸性至中性條件下相對穩(wěn)定，但在堿性條件下易發(fā)生水解或降解。在實際應(yīng)用中，該試劑需在嚴(yán)格無水條件下操作，推薦使用無水乙腈作為稀釋溶劑。DMT（二甲氧基三苯甲基）保護基的脫除通常在酸性條件下進(jìn)行（1% DCA或TFA的無水DCM溶液，25°C，1-2分鐘）。CE（氰乙基）保護基的脫除在堿性氨解條件下完成（濃氨水，60°C，5小時）。該試劑在溶液中可穩(wěn)定1-2天，配制后應(yīng)及時使用，避免降解。
【Part 3：相關(guān)應(yīng)用】
應(yīng)用1：點擊化學(xué)（CuAAC）介導(dǎo)的寡核苷酸位點特異性功能化標(biāo)記
C8-Alkyne-dT-CE-phosphoramidite的核心應(yīng)用是作為核酸固相合成的功能化單體，將C8位炔基修飾的脫氧尿苷（dU）引入DNA鏈中的特定位置。
應(yīng)用2：雙標(biāo)記及三標(biāo)記寡核苷酸的構(gòu)建與多重檢測
C8-Alkyne-dT-CE-phosphoramidite可用于構(gòu)建雙標(biāo)記甚至三標(biāo)記的寡核苷酸探針。
應(yīng)用3：實時熒光PCR（TaqMan）雙標(biāo)記水解探針的開發(fā)
C8-Alkyne-dT-CE-phosphoramidite在實時熒光定量PCR（qPCR）領(lǐng)域具有應(yīng)用價值，特別是用于開發(fā)雙標(biāo)記水解探針（TaqMan探針）。通過該單體在探針序列的特定位置引入炔基修飾，可在探針的一端連接淬滅基團，另一端連接熒光報告基團。
應(yīng)用4：RNA/DNA雜交研究與功能性核酸分子構(gòu)建
C8-Alkyne-dT-CE-phosphoramidite還可應(yīng)用于RNA和DNA雜交研究、核酸-蛋白質(zhì)相互作用解析以及功能性核酸分子的構(gòu)建。
【Part 4：同系列試劑】
C8-Alkyne-dC-CE-phosphoramidite（C8-炔基-dC-CE-亞磷酰胺），CAS: 1021300-97-9
C8-TIPS-Alkyne-dT-CE-phosphoramidite（C8-TIPS-炔基-dT-CE-亞磷酰胺）
C8-TMS-Alkyne-dT-CE-phosphoramidite（C8-TMS-炔基-dT-CE-亞磷酰胺）
C8-Alkyne-dU-CE-phosphoramidite（C8-炔基-dU-CE-亞磷酰胺 / C8-Alkyne-dU-CEP），CAS: 938186-76-6
5-Ethynyl-2'-deoxyuridine-CE-phosphoramidite（5-乙炔基-dU-CE-亞磷酰胺）
5-Ethynyl-2'-deoxycytidine-CE-phosphoramidite（5-乙炔基-dC-CE-亞磷酰胺）
5-Octadiynyl-dU-CE-phosphoramidite（5-辛二炔基-dU-CE-亞磷酰胺）
5-TIPS-ethynyl-dU-CE-phosphoramidite（5-TIPS-乙炔基-dU-CE-亞磷酰胺）
5-TMS-ethynyl-dU-CE-phosphoramidite（5-TMS-乙炔基-dU-CE-亞磷酰胺）
5-Ethynyl-7-deaza-2'-deoxyadenosine-CE-phosphoramidite（5-乙炔基-7-脫氮-dA-CE-亞磷酰胺）
5-Ethynyl-7-deaza-2'-deoxyguanosine-CE-phosphoramidite（5-乙炔基-7-脫氮-dG-CE-亞磷酰胺）
5-Ethynyl-7-deaza-2'-deoxycytidine-CE-phosphoramidite（5-乙炔基-7-脫氮-dC-CE-亞磷酰胺）
5-Vinyl-2'-deoxyuridine-CE-phosphoramidite（5-乙烯基-dU-CE-亞磷酰胺）
5-Norbornene-2'-deoxyuridine-CE-phosphoramidite（5-降冰片烯-dU-CE-亞磷酰胺）
5-Tetrazine-2'-deoxyuridine-CE-phosphoramidite（5-四嗪-dU-CE-亞磷酰胺）
Amino-dT-CE-phosphoramidite（氨基-dT-CE-亞磷酰胺）
Amino-dC-CE-phosphoramidite（氨基-dC-CE-亞磷酰胺）
Biotin-dT-CE-phosphoramidite（生物素-dT-CE-亞磷酰胺）
Fluorescein-dT-CE-phosphoramidite（熒光素-dT-CE-亞磷酰胺）
Cy3-dT-CE-phosphoramidite（Cy3-dT-CE-亞磷酰胺）
Cy5-dT-CE-phosphoramidite（Cy5-dT-CE-亞磷酰胺）
5'-DMT-2'-O-TBDMS-rU-CE-phosphoramidite（5'-DMT-2'-O-TBDMS-rU-CE-亞磷酰胺）
5'-DMT-2'-O-TBDMS-rC(Ac)-CE-phosphoramidite（5'-DMT-2'-O-TBDMS-rC(Ac)-CE-亞磷酰胺）
Long trebler phosphoramidite（長鏈三叉亞磷酰胺）
【Part 5：注意事項】
反應(yīng)條件建議：
偶聯(lián)（Coupling） ：推薦使用3分鐘的偶聯(lián)時間，采用與標(biāo)準(zhǔn)天然核苷亞磷酰胺相同的偶聯(lián)條件。稀釋劑為無水乙腈。
裂解（Cleavage）與脫保護：推薦在濃氨水中于60°C反應(yīng)5小時完成從固相載體的裂解及堿基保護基的脫除。對于快速脫保護亞磷酰胺，可使用AMA混合物（濃氨水/40%甲胺=1:1）于65°C反應(yīng)15分鐘。
pH條件：該試劑對水分高度敏感，所有操作需在嚴(yán)格無水條件下進(jìn)行。亞磷酰胺基團在酸性條件下穩(wěn)定，在堿性條件下易水解，應(yīng)避免暴露于堿性環(huán)境。
溫度條件：反應(yīng)在室溫（20-25°C）條件下進(jìn)行即可。該試劑應(yīng)在-20°C條件下長期保存。溶液狀態(tài)下的穩(wěn)定性為1-2天，配制后應(yīng)及時使用。
稀釋與配制：用無水乙腈將試劑稀釋至0.1 M濃度。配制后的溶液應(yīng)在1-2天內(nèi)使用完畢，避免因降解導(dǎo)致偶聯(lián)效率下降。
避光儲存要求：
該試劑對光、濕度和空氣敏感。應(yīng)在-20°C避光、干燥、惰性氣體（如氬氣）保護條件下密封保存。建議儲存于帶干燥劑的密封容器中，避免反復(fù)凍融。運輸可在室溫條件下進(jìn)行，最長不超過3周。未使用完畢的試劑應(yīng)立即密封并返回-20°C保存。產(chǎn)品在正確儲存條件下（-20°C，避光，干燥，惰性氣體保護）有效期至少為12個月。
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