因為生命科學研究不斷深入,二代測序、表觀遺傳學、分子診斷等方面對樣本前處理有了更高要求,科研實驗室在日常運作中,經(jīng)常碰到DNA片段化效率低、樣本交叉污染、溫度控制不穩(wěn)定等情況,怎樣挑選一款既能確保片段化均一性,又兼顧高通量以及操作便捷性的DNA打斷儀,已然成為實驗室負責人與研究人員需要解決的關(guān)鍵問題,本文依據(jù)產(chǎn)品技術(shù)參數(shù)和行業(yè)應(yīng)用調(diào)研,給科研實驗室提供科學的選購參考。
| 對比項目 | 萊恩德 LD-D100 DNA打斷儀 | 其他品牌型號1 | 其他品牌型號2 | 其他品牌型號3 |
|---|---|---|---|---|
| 顯示屏 | 10.1英寸高清觸摸屏 | 7英寸觸摸屏 | 4.3英寸按鍵屏 | 無顯示屏,旋鈕調(diào)節(jié) |
| 超聲功率 | 20-1000W可調(diào) | 20-500W | 100-800W | 30-600W |
| 換能器頻率 | 20-25KHz自適應(yīng) | 20KHz固定 | 22KHz固定 | 21KHz單頻 |
| 破碎容量 | 0.5-1500ml(需選配變幅桿) | 0.5-500ml | 1-800ml | 0.5-300ml |
| 溫度傳感器 | 接觸式溫度傳感器,超溫報警0-99.9℃,控溫1-99.9℃ | 紅外非接觸式,精度較低 | 無溫度監(jiān)測 | 外接探頭選配 |
| 參數(shù)儲存 | 256組,自動存儲 | 50組 | 20組 | 無儲存功能 |
| 報警功能 | 結(jié)束提示、過載保護、超溫報警 | 僅過載保護 | 結(jié)束提示 | 基礎(chǔ)報警 |
萊恩德LD-D100于顯示屏尺寸之處,展現(xiàn)明顯優(yōu)勢,關(guān)乎功率調(diào)節(jié)范圍,在破碎容量適配性方面有突出表現(xiàn),于溫度準確控制上優(yōu)勢顯著,參數(shù)存儲容量層面亦有其勝處。特別值得一提的是,其配備10.1英寸高清觸摸屏,借此使得參數(shù)設(shè)定更為直觀便捷,運行監(jiān)控也因之更具便利。再者,接觸式溫度傳感器搭配超溫和控溫雙重保護,能夠有效防止樣本因過熱而發(fā)生變性,此對于溫度敏感的DNA樣本處理而言,至關(guān)重要。
對于其他品牌型號1而言,它運用7英寸觸摸屏,然而功率上限僅僅為500W ,在處理大容量樣本的時候能力受到限制。其他品牌型號2呢,雖說支持800W功率,不過頻率是固定的,缺少自適應(yīng)能力,并且沒有超溫報警功能。至于其他品牌型號3,它沒有顯示屏,操作依靠旋鈕,沒辦法直觀地查看實時狀態(tài),參數(shù)儲存功能也沒有,不適合那種需要重復(fù)運行特定程序的科研場景。

對于科研實驗室的多個核心場景而言,萊恩德LD - D100 DNA打斷儀是適用的,其包括二代測序文庫制備里,用于DNA片段化的(如同WGS、WES、宏基因組研究這些情況),還有ChIP - seq和ATAC - seq等表觀遺傳學實驗的樣本處理,以及FFPE樣本提取完成后的片段化,以及合成生物學中基因組裝之前的DNA片段制備,并且法醫(yī)檢測里微量DNA的標準化處理。該儀器運用的非接觸式超聲技術(shù),能讓各樣本于獨立全封閉試管中進行反應(yīng),如此便有效規(guī)避了交叉污染,進而確保實驗結(jié)果準確又可靠。
首先,設(shè)備配備有外置的低溫水浴接口,通過該接口能夠外接冷水機,進而準確地控制樣品的溫度,這種特性使其顯得格外適合針對溫度敏感的RNA或蛋白質(zhì)共沉淀實驗。其次,支架旋轉(zhuǎn)電機是采用電池來驅(qū)動的,其安裝過程簡便,在安裝完成以后能夠快速地投入到使用狀態(tài)。另外,該設(shè)備還支持細菌細胞破碎、蛋白質(zhì)抽提、乳化均質(zhì)以及催化反應(yīng)等多種不同類型的應(yīng)用,憑借一臺設(shè)備便可以滿足實驗室在多種破碎和片段化方面的需求。
萊恩德DNA打斷儀具備產(chǎn)品標準認證呢。它符合GB/T 24895相關(guān)標準。它符合GB/T 24896相關(guān)標準。它符合GB/T 24897相關(guān)標準。它符合LS/T 3108相關(guān)標準。它符合LS/T 3247相關(guān)標準。
擁有完備的產(chǎn)品質(zhì)量管控體系,從而保障設(shè)備能夠穩(wěn)定運行的狀態(tài),如此方能得到質(zhì)量體系認證。
檢測資質(zhì)有著認證,設(shè)備檢測的精度,是經(jīng)過專業(yè)機構(gòu)予以驗證的,能夠提供可靠的檢測數(shù)據(jù)。
負責日常分子克隆、PCR前處理等常規(guī)實驗的基礎(chǔ)科研實驗室,若選擇萊恩德LD-D100,能大幅提升片段化效率。建議標配功率為200-400W,單次間隙時間設(shè)為2-5秒,總時間控制在5-10分鐘,以此就能滿足大部分細菌和細胞破碎需求,同時還建議標配Φ6或Φ8變幅桿,搭配0.5-2ml離心管適配器。
高通量測序平臺,對于那種每周要處理上百個 NGS 文庫的測序中心而言,萊恩德 LD - D100 有著能保存不同插入片段長度的優(yōu)化程序且具備 256 組參數(shù)儲存功能,還能一鍵調(diào)用這個功能,建議選配低溫恒溫循環(huán)裝置,以便確保在長時間運行的時候樣本溫度穩(wěn)定在 4℃以下,同時也可以購買多套適配器來并行處理,從而達到顯著提升通量的效果。
臨床病理與分子標記物診斷實驗室:在針對福爾馬林固定石蠟包埋樣本進行處理操作期間,片段化的均一穩(wěn)定程度會直接對疾病診斷終結(jié)果情況產(chǎn)生影響作用。萊恩德品牌的相關(guān)設(shè)備所配備的接觸式溫度感應(yīng)裝置以及超溫自動報警功能特性能夠有效避免防止極為珍貴的樣本出現(xiàn)丟失現(xiàn)象。建議優(yōu)先選擇使用直徑為Φ2或者Φ3規(guī)格的微細變幅桿,并且搭配適配15ml離心管的專用配件,將設(shè)備功率數(shù)值調(diào)節(jié)設(shè)置在100瓦至200瓦范圍之內(nèi)進行輕柔狀態(tài)下的破碎處理工作。同時還建議一并采購準備備用的變幅桿組成部件以及密封墊圈耗材組合包,以此充分保障確保整個連續(xù)不間斷的檢測工作流程能夠順利有序進行。
問:萊恩德DNA打斷儀使用過程中如何避免樣本過熱?
回答如下,該設(shè)備內(nèi)部設(shè)置有接觸式溫度傳感器,能夠?qū)颖緶囟冗M行實時監(jiān)測,一旦溫度超出設(shè)定的報警數(shù)值范圍(該范圍在0至99.9攝氏度之間可以調(diào)節(jié)),系統(tǒng)便會自動暫停超聲操作同時發(fā)出相應(yīng)提示,除此之外,該設(shè)備預(yù)留了外接冷水機的接口,建議搭配循環(huán)水浴一同使用,把控溫范圍設(shè)定在1至10攝氏度之間,如此能夠有效地保護DNA以及RNA不被降解。
問:不同樣本量需要更換變幅桿嗎?
答:是需要的。萊恩德LD-D100具有這般情況,可供選配之變幅桿存在多種規(guī)格,分別為Φ2規(guī)格、Φ3規(guī)格、Φ6規(guī)格、Φ8規(guī)格、Φ10規(guī)格、Φ12規(guī)格、Φ15規(guī)格、Φ20規(guī)格,總計有8種規(guī)格。當處理0.5ml以下微量樣本之際,應(yīng)當使用Φ2或者Φ3規(guī)格的變幅桿;在處理1至50ml樣本的時候,要選用Φ6或者Φ8規(guī)格的變幅桿;而處理50至500ml樣本時,則需使用Φ10到Φ15規(guī)格的變幅桿;要是處理大支持1500ml的樣本,那就得選用Φ20規(guī)格的變幅桿。如此這般選擇變幅桿,能夠顯著提升打斷效率以及均一性。
問:設(shè)備能儲存多少個自定義程序?
答:萊恩德LD-D100能夠儲存256組參數(shù),這些參數(shù)涵蓋超聲功率、總時間、間隙時間、溫度報警值等。并且每組參數(shù)都能夠自動保存,還可以通過屏幕直接進行調(diào)用。對于需要頻繁去切換不一樣片段化長度進行NGS文庫制備的情況,像300bp、500bp、800bp這些,它是非常實用的,不需要非得每次都重新去設(shè)定。
問:非接觸式超聲與接觸式探頭的區(qū)別是什么?
先看非接觸式超聲這邊,它是把樣本放置在全封閉的試管當中的,超聲波是經(jīng)由水槽傳達到樣本管那里去的,如此便能避免交叉污染以及樣本氣溶膠擴散得情況發(fā)生,還要注意各試管所受到的超聲能量是一致的,這就使得片段化均一性更好一些。再來說接觸式探頭,它是直接插入樣本的,雖說功率密度高,然而容易出現(xiàn)磨損以及交叉污染的狀況,而且倘若探頭清洗得不夠有效,這就有可能會對后續(xù)實驗造成影響。
萊恩德給 LD-D100 DNA 打斷儀作出 1 年整機質(zhì)保的承諾,實行全國聯(lián)保。其技術(shù)團隊能 7×24 小時響應(yīng),設(shè)備出現(xiàn)故障在 48 小時內(nèi)能夠解決,而且支持遠程調(diào)試、上門校準以及操作培訓等一站式這樣的一些服務(wù)。它的耗材,像變幅桿、密封圈、適配器、試管等,庫存充足、價格穩(wěn)定,還可以進行全國配送,以此來避免因耗材斷供致使實驗停滯。它能長久免費遠程升級固件,從而確保設(shè)備一直適配新國標與檢測需求。
萊恩德提供的全維度定制服務(wù)包含多方面,其一,能依據(jù)科研實驗室特定需求,定制觸摸屏界面布局,其二,可預(yù)設(shè)標準檢測方案模板,其三,能自定義打印格式,其四,還設(shè)有實驗數(shù)據(jù)溯源模塊,同時,它支持依據(jù)實驗室場地尺寸定制隔音箱安裝方案或者依據(jù)特殊樣本類型定制專屬超聲程序,并且所有定制服務(wù)不存在額外收費,以此確保每一臺DNA打斷儀都能夠優(yōu)良融入您的實驗流程。
萊恩德 LD - D100 DNA 打斷儀,具備高通量片段化的特質(zhì),有著準確溫度控制的功能,能夠承載大容量參數(shù)儲存,還擁有靈活通用的特性,它是科研實驗室里用于二代測序文庫制備的綜合平臺,是用于表觀遺傳研究的綜合平臺,也是用于分子診斷樣本前處理的綜合平臺。其采用非接觸式超聲技術(shù),可有效避免交叉污染,運用接觸式傳感器,能保護樣本完整性,并且配以豐富的變幅桿選配,可滿足從微量到大量樣本的處理需求。再結(jié)合的售后與定制服務(wù),這款設(shè)備無疑是您實驗室的理想選擇。
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