分子生物試劑: tiangen Beyotime selleck EZBioscience國內授權代理 celetrix addexbio adamas nano Tosoh Megazyme Advanced ImmunoChemical代理 ADS Biotec Ademtech inalco abpcorp abm abitec abgent abclonal abbott abberior AbboMax A-M systems Biocheck cusabio MCE MatTek ICl ProFoldin BioGrammatics aobious USP Proteintech QuaCell phadebas Parkell Omega NSJ Bioreagents ChromoTek Bioind bachem Apexbio Teknova ozbiosciences代理 pnabio Sage Science rPeptide Medical isotopes StemRD scripps SantaCruz Lifecore Genway Click chemistry tools Advanced Biotech AB vector QuickZyme Innovative Research of America Incell Formedium fapas zyagen nanohelix lucerna Innovative Cell Technologies Encapsula NanoSciences dianova alstem abbexa Worthington Viagen trilink panbio NIBSC matreya Enquirebio AGL Cell Guidance Systems ScienCell lucigen listlabs EpiCypher MicroGem RAN Biotech emfret Echelon Cape Cod aves labs aqix appexbio Pel-Freez PBL MRC-Holland mclab Merck CDN Isotopes Abways biotium leebio InGex Chromsystems Hellbio goldbio bioflux agrisera代理 agdia Advanced ImmunoChemical ABT beads beckman Creative PEGWorks Equitech genovis Horizon Kerafast mirus Maxim Biomedical invivogen Brainbits sero Engibody Biosearch Assaypro Advanced Cell Diagnostic Norgen NeuroMab E＆K Scientific國內授權代理 Spherotech Eastcoast Aviva NEB Affinity Biologicals zeptometrix Coriell Lsbio zymo toyobo abcam VMRD Nist國內授權代理 Greatcell solar Enzo Biolegend Cygnus Bethyl JPT 分子生物試劑代購 seracare國內授權代理 Lifesensors kapa國內授權代理 Sigma代理 SSI Diagnostica國內授權代理 G-biosciences國內授權代理 Fisher北京代理 Moltox國內授權代理 Vector Badrilla Bangs labs Expression system Chromogenix nano Composix BioChain國內授權代理 Agrisera Bioclone Cellscript Cyagen Chrono-log Epigentek Biorad Applied Biosystems Fitzgerald vwr Tocris Phyto GeneTex E＆K Scientific Eylabs Diazyme Cell Biolabs SP scienceware Signalchem Lexogen BioXcell AB Biolabs ImmunoVision GlycoTech Fisher Agar Scientific Abbiotec Thermo賽默飛 Takara Smobio HyPhen Biomed Axis-Shield Altogen Agilent安捷倫 Advansta Mybiosource Fortebio Biomerieux EMS Bioivt Usbio Advanced BioMatrix Toxin

KAPA 超外顯子組

時間：2024/5/28閱讀：2159

高效、均勻的基于雜交的全外顯子組測序捕獲

新的 KAPA HyperExome 探針池結合了十多年的探針設計經驗和改進的探針制造工藝，能夠高效、均勻地基于雜交捕獲全外顯子組測序 (WES)。實現對基因組變異的靈敏、可靠的檢測，包括外顯子區域內的單核苷酸變異 (SNV)、插入/缺失、拷貝數變異 (CNV)、基因融合、倒位和其他重排。

· 通過好的捕獲均勻性降低檢測變異所需的測序量，從而降低測序成本并節省時間

· 可靠地豐富具有挑戰性的、以前無法接近的外顯子區域

· 利用 387 個樣本追蹤 SNP確保準確識別樣本

· 使用由 KAPA HyperPrep 或 KAPA HyperPlus Library Prep Kits 驅動的 HyperCap Workflow v3簡化靶向測

性能數據

降低測序成本并節省時間

· 利用 KAPA HyperExome 緊湊的 ~43 Mb 設計優化測序吞吐量

· 與供應商 X 相比實現更好的覆蓋率，尤其是更深層次的排序

與供應商 X Exome 相比，KAPA HyperExome 具有更高的目標讀取百分比、更深的中值覆蓋率和更廣泛的目標覆蓋率。

降低測序成本并節省時間

圖 1.與供應商 X Exome 相比，KAPA HyperExome 具有更高的目標讀取百分比、更深的中值覆蓋率和更廣泛的目標覆蓋率。

對于 KAPA HyperExome 和供應商 X 外顯子組工作流程：對來自 16 個細胞系的 DNA 進行三次處理（每個工作流程總共 48 個文庫）；對輸入 DNA 進行酶切；在捕獲前將樣本以 8 個為一組進行多路復用并雜交 16 小時；用 8 個 PCR 循環擴增最終的捕獲后文庫；并在 Illumina® NovaSeq™ 測序儀上對文庫進行測序（2 x 100 bp）。對于 KAPA HyperExome 樣本，使用 KAPA HyperPlus 試劑盒、KAPA 通用適配器和 KAPA UDI 引物混合物從 100 ng DNA 制備文庫；在 8 個捕獲前 PCR 循環后在 55oC 下進行雜交和清洗。根據制造商的說明，從 50 ng 基因組 DNA 制備供應商 X 樣本。為了進行分析，測序數據按外顯子組面板大小按比例進行子采樣，以實現相同的目標平均覆蓋深度。

通過好的捕獲均勻性很大程度地提高吞吐量

· 利用設計專業知識和使用廣泛優化的面板來提高測序效率

· 即使在難以捕捉的區域也能實現最佳的整體平衡

KAPA HyperExome 實現高度均勻的覆蓋

圖 2. KAPA HyperExome 實現高度均勻的覆蓋——即使在 %GC 較高或較低的區域也是如此。

在使用 KAPA HyperExome 探針捕獲之前，使用 KAPA HyperPlus 試劑盒和 KAPA 通用適配器和 KAPA UDI 引物混合物從 100 ng DNA 中制備文庫。文庫 (8) 在捕獲前進行多路復用，與探針雜交 16 小時，捕獲后擴增，并在 Illumina NovaSeq 測序儀上測序 (2 x 100 bp)。條形圖表示來自 16 個不同細胞系的數據，重復處理三次。面板 B 中的每個數據集都來自不同的細胞系。

可靠地豐富具有挑戰性的、以前無法接近的外顯子區域

· 提高重要基因組數據庫（包括 ACMG59、CCDS 和 ClinVar）中關鍵研究基因的覆蓋率

· 使用全面而緊湊的 KAPA HyperExome 面板發現更多變體

可靠地豐富具有挑戰性的、以前無法接近的外顯子區域

圖 3.與供應商 X Exome 相比，KAPA HyperExome 對重要基因組數據庫的覆蓋范圍更廣。

確保樣品識別準確

研究人員經常使用對照加樣來跟蹤整個 NGS 工作流程中的樣本。但是，樣本處理錯誤仍然會導致樣本識別錯誤。HyperExome 針對 387 個選定的 SNP 位點，將其作為獨立于樣本處理的內在樣本標識符，使研究人員能夠：

· 消除與手動添加樣品跟蹤添加物相關的錯誤

· 提高 NGS 結果的可靠性，增強對樣本身份的信心

· 減少昂貴的樣品錯誤識別

北京和一生物科技有限公司專業代理antibodiesinc全系列產品，專營進口生物試劑，科學儀器，實驗消耗品，化工原料及藥物中間體等。公司與諸多國外品牌簽下代理，sigma、santa、RD、Abcam、CST、toxin、streck、Biolegend、ebioscience、saracare、polyplus、Beyotime、Novus、moltox等，能為廣大科研用戶提供數萬種試劑、儀器和實驗消耗品。

我們公司的優勢:

1：與500多家公司合作，基本什么品牌都能進口，包括血清，抗體，耗材，還有部分限制進口的

2：部分產品現貨，物流穩定

3：一手貨源，價格價格優，售后齊全，歡迎新老客戶咨詢訂購

KAPA 超外顯子組

會員登錄

收藏該商鋪

提示