
從培養(yǎng)細胞中提取總蛋白是最基礎的實驗操作之一。但貼壁細胞與懸浮細胞因其生長狀態(tài)不同,操作細節(jié)上有所差異。本文為兩種細胞類型提供標準化操作流程(SOP),并匯總常見問題及解決方案。
1. 全程低溫:所有操作在冰上或4℃條件下進行,緩沖液預冷。
2. 抑制劑現(xiàn)加:裂解液使用前立即加入蛋白酶抑制劑和磷酸酶抑制劑(如需)。
3. 裂解液選擇:根據(jù)下游實驗選擇(如RIPA用于總蛋白WB,NP-40用于IP)。
4. 裂解液用量參考:
l 6孔板:120-150 μL/孔
l 12孔板:80-100 μL/孔
l 60 mm培養(yǎng)皿:300-400 μL
l 100 mm培養(yǎng)皿:500-800 μL
l 懸浮細胞(1×10?):500-800 μL
1. 清洗:棄培養(yǎng)液,用預冷PBS輕柔清洗細胞3次,徹-底吸干殘留液體。
2. 裂解:加入含抑制劑的裂解液,冰上孵育10-20分鐘。期間每5分鐘晃動培養(yǎng)皿,使裂解液覆蓋均勻。
3. 收集:用預冷細胞刮快速刮下細胞,將裂解物轉(zhuǎn)移至預冷離心管。
4. 離心:4℃下12,000-14,000 rpm離心20分鐘。
5. 保存:取上清(即總蛋白),分裝,-80℃保存。
關鍵要點:
l 避免胰酶消化:盡量用刮刀收集細胞,胰酶可能剪切膜蛋白并激活信號通路。
l 處理粘稠樣品:若樣品呈粘稠拉絲狀(核酸污染),可在裂解后加入DNase I(10-20 U/mL,含2 mM Mg2?)冰上處理5分鐘,顯著降低粘度。
l 磷酸化蛋白:全程快速操作,從裂解到加入上樣緩沖液變性應在30分鐘內(nèi)完成。
l 收集細胞:將細胞懸液轉(zhuǎn)移至離心管,室溫300-500×g離心5分鐘,棄上清。
l 清洗:用預冷PBS重懸細胞,相同條件離心洗滌2次,棄上清,留下緊實細胞沉淀。
l 裂解:按細胞量加入冰冷裂解液,用移液器輕柔但充分吹打10-15次,重懸沉淀。
l 孵育:冰上孵育10分鐘。對于難裂解細胞,可進行短時超聲(1秒開/2秒停,共5-10次)。
l 離心:4℃下12,000-14,000×g離心10-15分鐘。
l 保存:取上清,BCA定量后,加入上樣緩沖液95℃變性5分鐘,分裝-80℃保存。
關鍵要點:
l 紅細胞污染:若樣本為血液或含紅細胞,先用紅細胞裂解液(RBC lysis buffer) 室溫處理1-2分鐘,離心棄上清后再進入洗滌步驟。
l 細胞量少:可適當減少裂解液體積以提高蛋白濃度。
l 顆粒物多:如漿細胞系,超聲步驟不可少,能顯著提高提取效率。
問題 | 可能原因 | 解決策略 |
蛋白濃度低 | 細胞量不足;裂解不充分;核酸干擾 | 增加起始細胞量;減少裂解液體積;加入超聲步驟;延長裂解時間至20分鐘 |
樣品粘稠(拉絲) | DNA釋放過多 | 加入DNase I(10-20 U/mL)并短暫孵育;增加一次高速離心 |
磷酸化信號丟失 | 磷酸酶未被抑制;操作時間過長 | 確保磷酸酶抑制劑新鮮且添加足量;30分鐘內(nèi)完成裂解至變性 |
樣品起泡或降解 | 操作劇烈(渦旋);未保持低溫 | 輕柔吹打,避免渦旋;全程冰上操作 |
蛋白條帶異常 | 蛋白降解 | 檢查抑制劑是否失效;確保樣品保存于-80℃且避免反復凍融 |
遵循標準化的SOP,根據(jù)細胞類型調(diào)整操作細節(jié),并警惕常見問題,能極大提高蛋白提取的成功率和重復性。對于新手而言,從貼壁細胞使用RIPA裂解液開始是較為穩(wěn)妥的選擇,逐步積累經(jīng)驗后再優(yōu)化條件。
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