總蛋白提取試劑盒的技術參數決定其在特定樣本類型上的適用邊界。KTP3006定位于普通實驗室的常規樣本(細胞、軟組織和部分植物)。以下十項參數需要在使用前理解。
緩沖劑:50mM Tris-HCl,pH 7.6(25℃測定)。溫度每升高10℃,pH下降0.3個單位。4℃時pH約為7.9,37℃時約為7.4。
離子強度:150mM NaCl。維持等滲環境,防止滲透壓沖擊導致細胞核破裂。
去垢劑組合:
SDS(十二烷基-硫-酸-鈉-):0.5%(w/v),對應濃度17.3mM,遠高于其CMC(2.3mM)。SDS使蛋白-完-全-變性并帶負電荷。
Triton X-100:1%(v/v),濃度約16mM,CMC為0.24mM。溶解膜脂和核膜。
脫氧膽酸鈉:0.5%(w/v),濃度為12mM,CMC為6mM。輔助破壞核膜和線粒體膜。
還原劑:DTT(二硫蘇糖醇)5mM。斷裂二硫鍵,還原半胱氨酸殘基。
烷基化試劑:碘乙酰胺10mM。封閉游離巰基,防止二硫鍵重新形成。
蛋白酶抑制劑混合物(單獨包裝):AEBSF 1mM、亮抑肽素10μM、抑肽酶1μM、E-64 10μM、EDTA 2mM。覆蓋絲氨酸、半胱氨酸、天冬氨酸和金屬蛋白酶。
基于標準操作流程(每100mg組織或5×10^6細胞加入1mL裂解液,冰上裂解20分鐘,16,000×g離心20分鐘),得率如下:
樣本類型 | 得率范圍 (mg/mL裂解液) | 批內CV (%) | 批間CV (%) |
HEK293細胞(貼壁) | 1.8-2.5 | 5.2 | 8.7 |
小鼠肝組織 | 12-18 | 6.8 | 11.3 |
小鼠腦組織 | 8-12 | 7.5 | 13.2 |
大鼠心肌 | 9-14 | 8.1 | 14.5 |
擬南芥葉片(液氮研磨) | 3-6 | 10.2 | 18.6 |
大腸桿菌(BL21) | 4-7 | 6.3 | 10.9 |
得率測定采用BCA法。低于下限可能原因:樣本降解、裂解不充分或抑制劑失活。
SDS-PAGE銀染檢測顯示,KTP3006提取的蛋白分子量覆蓋10kDa至250kDa。低于10kDa的多肽可能因未充分沉淀或被透析丟失。高分子量(>250kDa)蛋白如肌聯蛋白(titin)需降低離心力至8,000×g以防止沉淀。完整性檢測:使用抗β-肌動蛋白抗體(42kDa)檢測條帶無拖尾;抗HSP90抗體(90kDa)無降解片段。
裂解液初始pH 7.6。在加入酸性組織(如肌肉、肝臟,pH約6.5)后,混合液pH變化不超過0.3個單位。加入10μL 1M HCl或NaOH時,pH波動±0.2。該緩沖體系在pH 6.8-8.2范圍內維持穩定。超出此范圍,SDS會析出,蛋白發生酸堿水解。
KTP3006提取的總蛋白含有三種去垢劑。對于需要去除去垢劑的下游應用(如質譜、等電聚焦),推薦使用以下方法:
丙酮沉淀:加入4倍體積預冷丙酮(-20℃),-20℃放置2小時,16,000×g離心20分鐘。去垢劑去除率:SDS 99%,Triton X-100 95%,脫氧膽酸鈉 98%。蛋白回收率80-90%。
氯仿-甲醇沉淀:加入4倍體積甲醇、1倍體積氯仿、3倍體積水,離心。去垢劑去除率>99%,但疏水蛋白可能損失。
脫鹽柱(如Zeba Spin):分子量截留7kDa,去垢劑去除率僅60-70%,因為SDS形成膠束大于截留分子量。
定量方法 | 兼容性 | 校正方法 |
BCA法 | 高 | 用裂解液做空白對照,標準曲線中加入等量裂解液 |
Bradford法 | 低 | SDS干擾顯色,造成A595偏高2-3倍。需將樣品稀釋20倍以上使SDS<0.025% |
Lowry法 | 中等 | 脫氧膽酸鈉干擾,需預先用TCA沉淀 |
A280吸光度 | 低 | 去垢劑和DTT在280nm有吸收,誤差>50% |
推薦使用BCA法。KTP3006提供BCA工作液試劑盒(另配),檢測線性范圍0.05-1.5mg/mL,靈敏度0.01mg/mL。
未開封KTP3006:-20℃保存,有效期18個月。裂解液組分(不含抑制劑)可耐受5次凍融。抑制劑混合物(凍干粉)在-20℃下保存12個月,溶解后需在-80℃分裝保存,避免反復凍融。運輸條件:干冰或-20℃冰袋。裂解液在室溫下放置超過7天,SDS會水解為十二烷醇和硫酸氫鈉,導致SDS濃度下降和pH降低。
經驗證(數據來自說明書和第三方測試):
Western blot (還原或非還原)
SDS-PAGE
ELISA(需稀釋至去垢劑低于0.1%)
免疫沉淀(需稀釋至SDS低于0.01%)
質譜鑒定(需去除去垢劑)
蛋白激酶測定(DTT可能干擾,需透析去除)
蛋白交聯(碘乙酰胺需去除,否則與交聯劑競爭巰基)
不兼容:等電聚焦(SDS導致蛋白帶電荷均一化)、天然PAGE(蛋白已變性)。
SDS:刺激性,粉塵吸入導致呼吸道不適。工作濃度0.5%無明顯急性毒性。
Triton X-100:環境危害,水生生物毒性。建議廢液按非離子去垢劑處理。
DTT:惡臭,皮膚接觸可致敏。建議通風櫥操作。
碘乙酰胺:劇毒,潛在烷化劑。嚴禁接觸皮膚。
每批次KTP3006需通過三方面質控:
提取效力測試:用HEK293細胞提取總蛋白,BCA測定得率≥1.5mg/mL。
純度測試:Western blot檢測胞漿蛋白GAPDH陽性,核蛋白組蛋白H3陰性(污染率<1%)。
變性效力測試:SDS-PAGE上樣20μg蛋白,考馬斯亮藍染色顯示高分子量區域無聚集帶。
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