如有神“柱”| 寡核苷酸分析利器- BIOshell™ Å120 Oligo C18熔融核色譜柱
寡核苷酸是由2-30個核苷酸殘基通過磷酸二酯鍵連接而成的短鏈核酸片段,廣泛用于生物治療(包括基因治療、RNA干擾和反義寡核苷酸療法)而備受關注。這些化合物的治療效果高度依賴其純度和結構完整性,因此建立穩健的分析方法對質量控制至關重要。
HPLC法是監控寡核苷酸合成的關鍵技術,能為其純度和結構完整性提供有價值的參考。然而,由于寡核苷酸結構復雜且存在雜質,傳統的HPLC方法在分離寡核苷酸時面臨挑戰。提高 pH 和溫度的條件會進一步增加分離難度,因為傳統全孔顆粒(FPP)色譜柱的硅膠填料通常不適合此類條件。
BIOshell™ A120 Oligo C18色譜柱采用熔融核Fused-Core®顆粒技術,具有快速、高效的特點。表面改性的有機硅烷,具有耐堿性,在使用高pH值分離寡核苷酸時具有優異的穩定性,這項創新技術有助于開發穩健的方法,改善堿性化合物的分離效果。堿性化合物在低 pH 條件下通常峰形不佳、保留不足等問題。BIOshell™色譜柱表面惰性的硬件,很好的解決了樣品吸附問題,可用于生物惰性系統。
BIOshell™ ?120 Oligo C18色譜柱特點
· 120 ?孔徑:能分離長達60個堿基的寡核苷酸
· 高pH值和高溫條件下出色的穩定性:專為分離寡核苷酸而設計
· 兼容性:與UHPLC和質譜兼容的鍵合相
· 硬件經表面惰性處理:降低樣品吸附
· 鍵合相:表面修飾的二甲基十八烷基硅烷
顆粒大小: 2.7 μm
· 孔徑: 120?
· USP分類: L1
· 碳載量: 5.6%
· 表面積: 75m2/g
· 是否封端: 是
· 柱溫(低pH): 2/90 °C,柱溫(高pH): 9/85 °C
對比實驗
與全多孔色譜柱相比,BIOshell™ A120 Oligo C18柱在分離寡核苷酸方面表現出更優異的性能。如下圖,在高pH條件下,BIOshell™ A120 Oligo C18和其他供應商的寡核苷酸色譜柱分離不同長度的寡核苷酸混合物。在對比色譜柱上,由于全多孔色譜柱色譜柱擴散路徑增加,全多孔色譜柱峰形較差,20個堿基及以上的低聚物出現拖尾。由于BIOshell™ Fused-Core®顆粒色譜柱的快速和高柱效,相同樣品在BIOshell™色譜柱上無拖尾。
出峰順序:1.10 mer ,2. 15 mer, 3, 20 mer, 4. 25 mer ,5. 30 mer, 6. 40 mer ,7. 50 mer, 8. 60 mer
色譜條件:
色譜柱: BIOshell™ A120 Oligo C18, 2.7μm, 5 cm x 2.1 mm I.D.( 70003-U)
對比柱:Oligo 130A C18,1.7um,2.1*50mm
流動相A:100mM TEAA, pH 8.5
流動相B:乙腈
梯度時間:
Time | %B |
0.0 | 5 |
10.0 | 11 |
11.0 | 11 |
11.5 | 0 |
16.5 | 0 |
流速:0.5 mL/min
背壓:BIOshell™140 bar, 對比柱255bar
柱溫:60 °C
進樣體積:1.0 μL
樣品溶劑:10mM Tris HCl/1mM EDTA
檢測波長:UV/PDA, 254 nm
流通池:1 μL
采集頻率100 Hz
響應時間0.025 s
長寡核苷酸的分離:
寡核苷酸的分離:從20mer - 到100mer
使用BIOshell™A120 Oligo C18 INERTProve™色譜柱可以實現單鏈DNA(ssDNA)寡聚體的分離。如示例所示,這些色譜柱成功分離100-mer的寡核苷酸,展示了其精度和效率,以及處理復雜且長序列的能力。

分離寡核苷酸混合物
在高pH條件下使用BIOshell™ A120 Oligo C18色譜柱,可以在5分鐘內分離出含有6種不同寡核苷酸的樣品。
出峰順序:1.20 mer, 2. 15 mer ,3.12 mer ,4. 25 mer, 5. 33 mer, 6. 12 mer
色譜條件:
色譜柱:BIOshell™ A120 Oligo C18, 2.7μm, 5 cm x 2.1 mm I.D.(70003-U)
流動相A:100mM TEAA, pH 8.5
流動相B:乙腈
梯度時間:
時間 | %B |
0 | 7.5 |
5 | 15 |
5.3 | 60 |
5.6 | 60 |
8.0 | 7.5 |
流速:0.4 mL/min
背壓:142 bar
柱溫:50 °C
進樣體積:1 μL of Oligonucleotide Performance Standard Mix, 12-33 NT
樣品溶劑:10mM Tris HCl/1mM EDTA
檢測波長:PDA, 254 nm
流通池:1 μL
采集頻率:100 Hz
相應時間:0.05 sec.
分離不同大小寡核苷酸
以下是分離寡核苷酸標準混合物(含有10-60個ssDNA)的應用。使用了乙酸三乙胺(TEAA)和乙腈梯度洗脫。在3.5分鐘內,使用BIOshell™ A120 Oligo C18, 2.7μm, 5 cm x 2.1 mm I.D.( 70003-U),可分離長達60個堿基的寡核苷酸,并獲得優異的峰型和分離。
出峰順序:1.10 mer ,2. 15 mer, 3, 20 mer, 4. 25 mer ,5. 30 mer ,6 .40 mer ,7 .50 mer ,8. 60 mer
優異的批間重現性
使用4個不同批次的色譜柱,對含10-60個不同長度堿基的單鏈DNA樣品進行分析。
出峰順序:1. 10 mer, 2. 15 mer ,3. 20 mer ,4. 25 mer ,5. 30 mer ,6. 40 mer ,7. 50 mer ,8. 60 mer


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