酸性堿性有機溶劑凍干機在凍干的樣品中多數用戶的溶劑為水，但也有些用戶凍干的樣品中的溶劑含有大量其它的酸性物質、堿性物質或有機物，如蛋白質的乙腈溶液、乙醇、葉酸、弱堿等其它物質，這些物質在-50℃的冷阱上不能有效的凝結成固態，這些物質由于具有酸性或堿性，就會對真空管道進行腐蝕、對有機材料的閥門進行腐蝕、對油封真空泵腔體及密封圈進行腐蝕。這樣普通的凍干機使用一段時間后真空系統就會泄露，以至無法修復，真空泵就會損壞直至無法使用。

酸性堿性有機溶劑凍干機組件包括：
 

1）冷阱溫度需選用-85 ℃或-135 ℃，-58 ℃不能再被選用，冷阱材料需是316不銹鋼，其它如201、304等不銹鋼對酸堿腐蝕均有腐蝕作用。
2）根據客戶的酸堿需求需對真空管道、閥門做耐酸堿處理，以使得真空管道在*酸性或堿性凍干條件下不被腐蝕漏氣。
3）在真空泵入口連接酸或堿過濾器。
4）如果必要可選擇酸或堿有一定耐腐蝕性的真空泵，（耐腐蝕真空泵或雜交泵不在A組件內，需另行購買）。