您是否遇到這些難題?
1. 固定組織(PFA)無法提取高質量RNA?
2. 樣本異質性強,結果不準確、不可靠?
3. 單細胞/空間轉錄組成本高、分辨率受限?
4. 珍貴病理樣本有限,不足夠開展多個實驗?
例如在肝臟等復雜組織研究中提取RNA分析面臨以下挑戰:
組織異質性嚴重:肝臟包含肝細胞、膽管上皮、免疫細胞等,傳統整體提取難以反映真實表達差異
空間信息丟失:單細胞測序需組織解離,破壞細胞原位信息
技術方案受限:空間轉錄組:圖像分辨率或通量受限;傳統 LCM(Laser Capture Microdissection,激光捕獲顯微切割)大多使用新鮮樣本,無法利用大量病理固定組織
病理固定組織RNA難以提取,降解快,缺乏標準化流程
臨床樣本珍貴:無法轉化為高質量和足夠的RNA分析數據。
激光顯微切割,即LMD(Laser Microdissection)技術,精準從組織切片中分離目標單細胞 / 特定組織區域,適配后續核酸提取測序。南方醫科大學汪艷教授團隊發表于Journal of Visualized Experiments的工作中,第一作者曾偉蘭博士作為方法學核心執行人,依托學校科研支持中心(中心實驗室)平臺及該平臺配備的徠卡LMD激光顯微切割系統,成功構建了一套從固定組織到RNA測序的標準化解決方案,實現精準到單細胞級別分選,兼容PFA固定+冰凍切片樣本,5天內完成從取材到測序建庫,1000個細胞即可獲得高質量RNA分析結果的實踐方案。該方案提供了一套完整可重復的標準化實驗流程:樣本制備 → LMD 精準切割 → RNA提取 → qPCR / RNA-seq。
真正實現:固定組織 → 精準分選 → 高通量分子分析

關鍵技術突破
01、固定組織RNA提取優化
控制PFA固定時間24h,避免蛋白-核酸過度交聯不可逆損傷RNA
優化解交聯 + 蛋白酶K消化體系,提高RNA釋放效率
RNase全流程控制,保障RNA穩定性
02、高效LMD取樣策略
快速蘇木素染色替代復雜免疫染色
單張切片30–60min內完成切割,全部切割4h內結束,高效完成目標采集
精準圈選目標細胞群,避免污染
03、微量樣本高質量輸出
1000 cells → \~110 ng RNA
A260/A280:1.9–2.1
文庫片段:300–500 bp(符合測序要求)
該方案從臨床到科研全面釋放樣本價值:
肝病機制研究(MASH、肝損傷、纖維化等)
特定細胞群表達譜分析
微環境與免疫細胞研究
固定病理樣本回顧性研究
為什么選擇徠卡LMD激光顯微切割系統
高精度激光切割,細胞級分辨率
參數可控,適配不同組織類型
可在空間背景下通過可視化控制,實現純凈、無接觸、無污染的樣本采集
具備高通量處理能力,適應下游質譜等分析需求
樣本采集使用標準耗材,通用方便
LMD激光顯微切割系統不僅是一臺激光顯微切割顯微鏡,更是一套完整DVP解決方案,將細胞顯微結構與分子連接,打開病理樣本高價值再利用的可能。
汪艷教授團隊優化的LMD顯微切割步驟:
本流程參考了既往文獻的LMD通用操作規范,并針對固定組織中RNA易降解的特性,進行了優化調整。
1.用去除RNase試劑擦拭實驗臺面與儀器表面。
2.開啟LMD控制器,等待顯微鏡完成初始化。
3.擰動激光器鑰匙至開機檔位,啟動LMD激光系統。激光預熱10分鐘。
4.打開電腦及LMD軟件,等待軟件初始化結束。
5.將0.2mL PCR管裝入收集裝置。
6.在PCR管蓋中加入10μL RNA提取緩沖液(RNeasy FFPE 試劑盒配套試劑)。
7.將收集裝置裝回顯微鏡。
8.在LMD收集設備設置界面,點擊 “移至參考點",調節相機焦距使參考點成像清晰,必要時通過方向按鍵將參考點調至視野中央,進行收集設備位置校準。
9.組織切片面向下、標簽朝右裝入標本夾。
10.選用10倍物鏡定位樣本區域,進入激光菜單點擊校準,彈窗選擇確認。
11.設置激光參數(供參考):Power 50、Aperture 5、Speed 9。
12.工具欄圈選目標區域,選擇單一圖形,點擊開始切割;組織粘連無法自動掉落時,可選用手動裁切模式。警示:操作中禁止直視激光束,防止輻射損傷。
13.可通過軟件菜單保存切割前后鏡下畫面。
14.收集足量細胞后卸下收集組件,再次向管蓋補加提取緩沖液至終體積10μL,密封PCR管。
15.充分渦旋混勻收集管。
16.短暫離心,樣品- 80℃保存待用。后續樣本重復5~16步,切割結束可暫停實驗,待統一提取RNA。
注意:單張玻片樣品顯微切割用時控制在30分鐘~1小時,全部切割操作建議4小時內完成。
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