一、產品概述

6-ROX SE（6-Carboxy-X-rhodamine, succinimidyl ester）是 5(6)-ROX SE經純化獲得的單一異構體形式。由艾美捷代理AAT Bioquest推出，貨號：AAT-392。該試劑通過琥珀酰亞胺酯（NHS 酯）官能團與伯胺基團反應，主要用戶核苷酸標記和核酸測序等應用場景。作為羅丹明家族的成員，ROX 在熒光光譜上具有獨特的定位--激發峰 578 nm，發射峰 604 nm，是aPCR中常用的被動參比染料。

二、產品基本信息

參數 | 數值

外觀 | 紫色固體

分子量 | 631.67 Da

溶解性 | 溶于 DMSO

激發峰 | 578 nm

發射峰 | 604 nm

儲存條件 | 冷凍（<-15°C），嚴格避光

有效期 | 收貨后 6 個月

三、關鍵注意事項：ROX 的不穩定性

與 Alexa Fluor 或 Cy 系列等光穩定性優異的染料不同，ROX對儲存條件極為敏感。相較于其他羅丹明類染料，ROX的化學結構使其更容易發生降解，具體表現為熒光信號衰減或光譜偏移。

必須嚴格遵守以下操作規范：

1、嚴格冷凍儲存：必須保存在-15°C 以下環境，不可冷藏或室溫放置

2、最大限度避光：所有操作及儲存容器均需使用鋁箔包裹或棕色瓶

3、及時使用：有效期僅6個月，自收貨起，建議分裝后單次使用，避免反復凍融

4、溶劑選擇：僅使用DMSO復溶，避免使用含伯胺的溶劑（如 Tris 緩沖液會消耗 NHS 酯活性）

四、主要應用

6-ROX SE 通過 NHS 酯化學與胺修飾的寡核苷酸或核苷酸共價偶聯，主要應用于：

核酸測序：作為熒光標記物摻入測序反應體系

核苷酸標記：制備熒光標記的

dNTP 或 ddNTP

qPCR 校正：作為被動參比染料，校正非PCR相關的熒光波動

五、與其他 ROX 形式的區別

產品 | 說明

5(6)-ROX SE | 混合異構體，未經分離

6-ROX SE | 單一純化異構體，光譜性能和標記一致性更優

相較于混合異構體，6-ROX SE 提供更均一的標記產物和更可重復的熒光特性，適用于對標記質量要求較高的核酸分析應用

綜上，6-ROX SE 在核酸標記應用中具有特定價值，但其不穩定性要求使用者在儲存和操作全流程中保持高度規范，以獲得可靠且可重復的實驗結果。

文獻參考：

Four-color DNA sequencing by synthesis on a chip using photocleavable fluorescent nucleotides

Authors: Seo TS, Bai X, Kim DH, Meng Q, Shi S, Ruparel H, Li Z, Turro NJ, Ju J.

Journal: Proc Natl Acad Sci U S A (2005): 5926

Evaluation of surface-enhanced resonance Raman scattering for quantitative DNA analysis

Authors: Faulds K, Smith WE, Graham D.

Journal: Anal Chem (2004): 412

Photocleavable fluorescent nucleotides for DNA sequencing on a chip constructed by site-specific coupling chemistry

Authors: Seo TS, Bai X, Ruparel H, Li Z, Turro NJ, Ju J.

Journal: Proc Natl Acad Sci U S A (2004): 5488

Adsorption of oligonucleotides on PMMA/PNIPAM core-shell latexes: polarity of the PNIPAM shell probed by fluorescence

Authors: Prazeres TJ, Santos AM, Martinho JM, Elaissari A, Pichot C.

Journal: Langmuir (2004): 6834

Blue light-induced generation of reactive oxygen species in photoreceptor ellipsoids requires mitochondrial electron transport

Authors: Yang JH, Basinger SF, Gross RL, Wu SM.

Journal: Invest Ophthalmol Vis Sci (2003): 1312