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一、產(chǎn)品概述
6-ROX 甘氨酸熒光參比液(25 µM)是一種即用型液體試劑,主要用于實時熒光定量PCR(qPCR)檢測中的熒光信號歸一化校正。6-ROX glycine *25 uM fluorescence reference solution for PCR reactions由艾美捷代理AAT Bioquest推出,貨號:AAT-395。該產(chǎn)品在 6-ROX 染料的基礎(chǔ)上通過甘氨酸修飾顯著提升了穩(wěn)定性,克服了ROX傳統(tǒng)上易講解的固有缺陷,同時完整保留了與 6-ROX 一致的光譜特性。
二、產(chǎn)品基本信息
參數(shù) | 數(shù)值
外觀 | 深紅色液體
分子量 | 591.65 Da
溶解性 | 溶于水
工作濃度 | 25 µM
激發(fā)峰 | 578 nm
發(fā)射峰 | 604 nm
儲存條件 | 冷凍(<-15°C),嚴(yán)格避光
有效期 | 收貨后 12 個月
三、配方組成與穩(wěn)定性優(yōu)化
該產(chǎn)品為即用型溶液,基質(zhì)配方如下:
組分 | 濃度/含量 | 作用
6-ROX 甘氨酸 | 25 µM | 熒光參比染料
Tris | 20 mM(pH 8.4) | 緩沖體系
EDTA | 0.1 mM | 螯合金屬離子,保護(hù)核酸
Tween® 20 | 0.01% | 非離子表面活性劑,減少吸附
穩(wěn)定性突破:傳統(tǒng) 6-ROX在羅丹明家族中極不穩(wěn)定,而該產(chǎn)品的甘氨酸修飾形式顯著改善了這一短板--有效期從常規(guī) 6-ROX SE 的 6 個月延長至 12 個月,切以水溶性液體制劑形式提供,無需復(fù)溶,開蓋即用,簡化了操作流程并降低了因復(fù)溶操作引入的誤差風(fēng)險。
四、qPCR 參比原理
在 qPCR 實驗中,不同反應(yīng)孔之間因蒸發(fā),加樣體積差異或儀器光路偏差等因素,會導(dǎo)致熒光信號讀數(shù)的孔間波動。6-ROX甘氨酸作為被動參比染料(Passive Reference Dye),其自身熒光信號不參與靶標(biāo)擴(kuò)增檢測,而是作為每個反應(yīng)孔的內(nèi)參信號。儀器通過計算“靶標(biāo)熒光強(qiáng)度 / ROX 熒光強(qiáng)度"的比值,對每個孔進(jìn)行獨立校正,從而消除非生物學(xué)因素的干擾,使不同孔之間的ct值更具可比性,顯著提升數(shù)據(jù)精度。
五、操作注意事項
1. 使用前充分混勻,避免氣泡產(chǎn)生
2. 按儀器廠商推薦的終濃度添加至 qPCR 反應(yīng)體系中(不同品牌儀器對 ROX 濃度要求不同,需根據(jù)說明書調(diào)整)
3. 儲存于 -15°C 以下,避免反復(fù)凍融;建議分裝后單次使用
4. 操作過程中注意避光,防止光漂白
綜上,6-ROX 甘氨酸熒光參比液以其即用型配方、延長的穩(wěn)定性和完整保留的光譜特性,為 qPCR 實驗提供了一種更可靠的信號校正解決方案,尤其適用于對數(shù)據(jù)重復(fù)性要求較高的高通量檢測場景。
文獻(xiàn)參考:
Four-color DNA sequencing by synthesis on a chip using photocleavable fluorescent nucleotides
Authors: Seo TS, Bai X, Kim DH, Meng Q, Shi S, Ruparel H, Li Z, Turro NJ, Ju J.
Journal: Proc Natl Acad Sci U S A (2005): 5926
Evaluation of surface-enhanced resonance Raman scattering for quantitative DNA analysis
Authors: Faulds K, Smith WE, Graham D.
Journal: Anal Chem (2004): 412
Photocleavable fluorescent nucleotides for DNA sequencing on a chip constructed by site-specific coupling chemistry
Authors: Seo TS, Bai X, Ruparel H, Li Z, Turro NJ, Ju J.
Journal: Proc Natl Acad Sci U S A (2004): 5488
Adsorption of oligonucleotides on PMMA/PNIPAM core-shell latexes: polarity of the PNIPAM shell probed by fluorescence
Authors: Prazeres TJ, Santos AM, Martinho JM, Elaissari A, Pichot C.
Journal: Langmuir (2004): 6834
Blue light-induced generation of reactive oxygen species in photoreceptor ellipsoids requires mitochondrial electron transport
Authors: Yang JH, Basinger SF, Gross RL, Wu SM.
Journal: Invest Ophthalmol Vis Sci (2003): 1312
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