試劑詳情
英文名稱:AIE-Gelgreen Nucleic Acid Dye
分子式:C38H34N2O4S(典型結構,基于AIE活性基團與核酸結合單元)
溶解性:溶于DMSO、DMF、乙醇等有機溶劑,微溶于水
注意事項:現配現用,不可頻繁解凍,長期儲存需分裝后置于-80℃
分子構成與結構特點
AIE-Gelgreen 核酸染料屬于聚集誘導發光(AIE)類熒光染料,其分子核心由四苯乙烯(TPE)骨架構成,通過柔性連接臂與帶正電荷的季銨鹽基團相連。TPE骨架作為AIE活性單元,在自由旋轉狀態下熒光微弱,但當分子因與核酸結合或在水相中聚集而限制分子內旋轉(RIR)時,熒光強度顯著增強。季銨鹽基團則賦予分子與DNA雙螺旋小溝或RNA單鏈區域靜電結合的能力,確保染料在核酸存在下實現高選擇性點亮。
該染料的激發峰位于約490 nm,發射峰位于約530 nm,與常見的SYBR Green I光譜高度重疊,兼容大多數標準凝膠成像系統及熒光定量PCR儀器。分子設計上引入了甲基與苯環的位阻效應,有效降低了背景熒光干擾,在未結合核酸狀態下溶液的熒光量子產率低于0.01,結合后提升至0.6以上,信噪比優勢明顯。
主要應用領域
1. 瓊脂糖凝膠電泳中的核酸染色
AIE-Gelgreen 可直接加入熔融瓊脂糖中(終濃度為1×)或電泳后浸泡染色。推薦染色條件:室溫避光浸泡20-30分鐘,再用去離子水漂洗5分鐘去除多余染料。使用302 nm或365 nm紫外燈激發可觀察到清晰條帶,靈敏度可達0.5 ng DNA/條帶,低于傳統EB染料的檢測下限。
2. 聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)染色
針對小片段DNA或RNA分析,將染料以1×濃度溶于電泳緩沖液(如1×TBE),在電泳結束后對凝膠進行浸泡染色,時間延長至40分鐘,可有效染色小至20 bp的核酸片段,背景均勻性優于SYBR系列。
3. 熒光定量PCR(qPCR)中的實時監測
該染料可作為qPCR反應中的DNA結合染料使用,在延伸階段熒光信號隨擴增產物累積而線性增強。反應體系中建議終濃度為0.5×至1×,需注意優化引物濃度及退火溫度,避免因染料濃度過高導致PCR抑制現象。
操作規范與儲存條件
儲存規范
對出廠原液(通常為10000× DMSO溶液)進行分裝,每管50 μL或100 μL,密封后置于-20℃冰箱避光保存AIE-Gelgreen 核酸染料,避免反復凍融。若需長期儲存(超過3個月),建議轉移至-80℃環境。DMSO溶液在常溫下可穩定存放24小時,但不建議室溫暴露超過2小時。
工作液配制
用DMSO或滅菌去離子水將原液稀釋至工作濃度(通常為100×或10×),稀釋后工作液需在4℃避光條件下于2周內用完。注意:溶解時需充分渦旋振蕩,確保無結晶析出。若出現沉淀,可短暫加熱至37℃并超聲輔助溶解。
電泳染色操作
預染法:將染料按1:10000比例直接加入熔融瓊脂糖中(溫度降至50-60℃),混勻后制膠。注意高溫會破壞染料結構,切勿在瓊脂糖沸騰時加入。
后染法:電泳結束后將凝膠浸泡于含1×染料的1×TBE緩沖液中,室溫輕搖20分鐘,隨后用去離子水脫色10分鐘。后染法可降低因染料遷移對條帶分辨率的影響。
有關試劑
AIE-Gelgreen 核酸染料(標準型,用于DNA/RNA檢測)
AIE-Gelgreen Plus 核酸染料(增強型,靈敏度提升至0.25 ng/條帶)
SYBR Green I 核酸染料(經典替代品,需避光操作)
SYBR Safe 核酸染料(低毒替代品,適用于教學實驗)
GelRed 核酸染料(高靈敏度,安全性優于EB)
EB(溴化乙錠,傳統染色劑,具致突變性,需規范處理廢棄液)
注:該試劑僅用于科學研究,不能用于人體實驗或其他治療型用途。
供應商:西安凱新生物科技有限公司
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