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什么是內參?
內參 (Internal Control/Reference) :是指在科研實驗中作為基準參照物的一類分子,通常是蛋白質或 RNA。它們由管家基因編碼,在各種細胞或組織中恒定表達,不受實驗處理的影響。
內參擁有兩大核心特質:穩定性強、豐度高。
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不加內參?絕對不行!
內參并不是“湊數條帶",沒有規范內參的定量實驗,基本等于無效實驗。
作用一:空白對照
內參可作為空白對照,評估實驗全流程。基于內參穩定性強、豐度高且穩定的特性,正常情況下,內參是一定能跑出來的!如果內參條帶清晰、整齊,說明你的樣品處理、電泳、轉膜、發光這些步驟都沒問題。
作用二:校正誤差
實驗中需要確保各個加樣孔的蛋白上樣量一致,排除因加樣體積偏差或蛋白定量不準導致的假陽性/假陰性。
正常情況下,顯色后,各個孔的內參條帶在肉眼觀察下寬度一致、灰度值 (或熒光強度) 相近,這可直觀表明每個泳道 (加樣孔) 的總蛋白轉膜量大致相同。
若內參條帶存在不清晰、缺失或深淺不一的情況,說明實驗本身存在問題,需要先回溯排查實驗步驟。

注意!!!校正看的是蛋白總質量,不是上樣體積!體積一致 ≠ 上樣量一致。
作用三:歸一化定量
肉眼看條帶深淺,只能叫“感覺有差異",不能叫“統計學差異"。所有正規 SCI 定量結果,必須經過歸一化 (Normalize) 校正:
WB 相對表達量 = 目的蛋白灰度值 ÷ 同泳道內參灰度值

當然,部分文獻的 WB 結果圖下方還會附加一張柱狀圖,縱坐標即為“相對灰度值",可以清晰直觀地展示出實驗組與對照組之間的表達差異。

內參并不是隨便選一個就能用的。針對不同的實驗條件、不同的組織樣本以及不同的靶標蛋白,內參的選擇都有相應的講究。
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如何根據自身實驗選內參?
原則上,內參的選擇是要根據目的蛋白的分子量大小以及樣本類型來定。
分子量錯開
分子量最好相差 5 kDa 以上。
內參與目的蛋白分子量太近,條帶會粘連、重疊,無法單獨摳灰度定量;差距太大又會導致電泳分離過度,不在同一張膜有效區間。相差 5 kDa 以上最穩妥。
樣本種屬匹配
哺乳動物細胞/組織 (如人、小鼠、大鼠) 可選擇 GAPDH、β-Actin 等;
植物樣本則選擇 Plant Actin 等;
其他稀少物種:參照已發表文獻,選擇高度保守的管家基因表達蛋白作為內參。
與實驗條件適配
首先要考慮的是,你的實驗處理是否影響內參?例如,某些特定的藥物處理或缺氧實驗可能會改變 GAPDH 的表達,此時建議使用 β-Actin 。
其次,還要考慮目的蛋白的表達部位。例如核蛋白的內參要考慮用 Lamin A,Lamin B,Histone H3 等;膜蛋白的內參一般用 N-Cadherin。
表 1. 不同表達部位常用內參。
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內參“錦囊":實驗場景
磷酸化蛋白檢測
磷酸化蛋白檢測需使用雙內參!!!
1. 常規內參:作為實驗體系的對照,如 GAPDH 等。
2. 磷酸化蛋白對應的總蛋白:如檢測 p-Akt 時,一定要同時檢測 Total-Akt。 因為磷酸化蛋白條帶變強弱,可能是總蛋白量變了,不是磷酸化水平變了,需要用總蛋白進行校正。

缺氧/誘導糖尿病等因素
在進行缺氧或誘導糖尿病等處理時,GAPDH 的表達水平會發生顯著增高,不適合作為內參[5]。 此時,可按需選擇使用 β-actin、α-Tubulin 或 Lamin B 做內參。
1. 缺氧環境:細胞在缺氧條件下,為維持能量代謝,會啟動代償機制來增強糖酵解途徑。作為糖酵解的關鍵酶,GAPDH 的表達量會被顯著上調。

2. 誘導糖尿病:在高糖環境或糖尿病模型中,細胞的代謝途徑,特別是葡萄糖代謝,發生劇烈改變,直接影響 GAPDH 的代謝活性和表達水平。

此外,部分抗癌和真菌藥物處理時,Tubulin 表達會受影響,不適合作為內參。Tubulin 是細胞骨架的主要成分,而許多抗癌藥物 (如紫杉醇、長春堿) 和抗真菌藥物 (如灰黃霉素) 的作用機制正是通過靶向結合微管蛋白來干擾細胞分裂。因此,這類藥物處理會直接改變 Tubulin 的表達量或聚合狀態,導致其無法作為穩定的內參蛋白。此時,可嘗試選擇 β-actin、GAPDH、Histone H3 或 Lamin B 做內參。
細胞功能或狀態變化
1. 細胞增殖實驗:c-Jun 自身表達會變化,不適合作為內參[9]。
2. 凋亡實驗:TBP、Lamin 在凋亡過程中表達或定位會變化,不適合作為核內參。

組織特異性
(1) 脂肪組織:β-Actin 的表達量非常低,不適合作為內參。
(2) 多組織多細胞樣本對比:GAPDH 作為代謝類蛋白,在活組織中表達比較恒定,因此多組織多細胞樣本對比時,建議選用 GAPDH 作內參[11]。β-Actin 和 β-Tubulin 等結構蛋白在不同組織中會有表達差異。
(3) 細胞骨架相關的蛋白研究,不適合用 β-actin 作為內參,因為細胞骨架的重組可能會影響 β-actin 的表達。
特殊組織、樣本的內參選擇
(1) 骨骼肌、心肌、平滑肌:Tubulin 表達改變,不適合作為內參。
(2) 血漿、乳汁、組織液等分泌樣本:由于沒有完整的細胞結構,可選擇分泌型蛋白如 Transferrin 作內參。
下面是小 M 給大家整理匯總了常用內參!建議一鍵收藏,隨時翻看~
表 2. 常見內參選擇匯總。
內參、Western blot、WB、蛋白內參、管家基因內參、Western blot、WB、蛋白內參、管家
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