Q Exactive Plus vs Q Exactive HF 完整選型指南

一、核心硬件本質區別

1. 軌道阱核心（最關鍵差異）

• Q Exactive Plus：標準場 Orbitrap

  最高分辨率：140,000 @ m/z 200；選配 Biopharma 包最高 280,000Thermo Fis...

  最高掃描速度：12 Hz @17,500 分辨率，循環速度慢

• Q Exactive HF：超高場 D20 小型 Orbitrap（場強≈Plus 1.8 倍）

  原生最高分辨率：240,000 @ m/z 200，無需額外付費升級

  分辨率 15,000 下掃描速度18 Hz，同分辨率下循環速度比 Plus 快 30%~50%

2. 關鍵參數對比表

二、性能帶來的實驗差異

1. 蛋白組學（Bottom-up）

   HF 同梯度下多鑒定20% 蛋白、30% 獨特肽段；可把 120 min 梯度壓縮至 60 min，通量翻倍；DDA 能容納更多母離子（Top20/Top25），復雜細胞 / 組織樣本深度碾壓 Plus。

2. DIA 非靶向定量

   HF 更快掃描速度大幅降低 DIA 窗口重疊、丟失碎片；復雜血漿 / 腫瘤樣本定量重現性、覆蓋度遠優于 Plus。

3. 完整蛋白 Top-down / 單抗表征

   HF 超高分辨可基線分辨單抗輕重鏈同位素峰；Plus 僅能做簡單完整蛋白，復雜修飾單抗解析吃力。

4. 小分子代謝 / 脂質 / 食品環境篩查

• Plus：常規農殘、獸殘、臨床代謝、靶向 PRM 夠用，性價比高；

• HF：復雜基質（糞便、土壤、血漿）未知物定性、脂質異構體區分、低豐度標志物篩查更有優勢。

5. 靶向定量 PRM

   兩者均可；但 HF 更快循環，可同時監測更多目標物，適合高通量多靶點臨床樣本。

   
   

6. 

三、分場景選型判斷（直接對照）

? 選 Q Exactive Plus 的情況

1. 預算有限，以小分子為主

   食品、環境、毒理、常規臨床代謝、藥物雜質確證，日常篩查 + 定量，不需要超高通量。

2. 蛋白組僅做基礎小樣本

   少量細胞、簡單微生物，每月樣本量少，不追求深度覆蓋、不做 TMT 多重標記。

3. 以常規 UHPLC（非納流）為主

   1.0/2.1 mm 色譜柱，流速高、峰寬窄需求低，不需要超快掃描。

4. 對外共享平臺、多領域混合使用

   兼顧小分子 + 少量蛋白，平衡成本與通用性，日常維護壓力小。

5. 僅需中等分辨率定性

   無大量同分異構體、脂質、完整單抗表征需求。

? 選 Q Exactive HF 的情況

1. 深度蛋白質組學為核心方向

   細胞、組織、血漿、腫瘤樣本；Label-free、TMT 標記、磷酸化 / 泛素化修飾組；大批量樣本高通量分析。

2. Top-down 完整蛋白、抗體藥表征

   單抗分子量、糖基化、輕重鏈修飾、完整蛋白同位素精細解析。

3. DIA 非靶向組學（代謝 / 脂質 / 蛋白）

   復雜生物樣本，需要覆蓋度、低豐度標志物挖掘。

4. 快速液相、超短梯度高通量流程

   納流 LC、毛細管液相、30/60 min 快速梯度，追求單位時間樣本產出。

5. 高難度復雜基質未知物鑒定

   內源性脂質異構體、微量污染物、共流出干擾嚴重樣品，需要 240k 超高分辨區分質量差極小的峰。

6. 實驗室樣本量大、長期高通量產出

   課題組 / 平臺常年大批量測序，需要縮短單針運行時間、提升年產出。

四、折中與補充建議

1. 僅做小分子、少量蛋白 → Plus，性價比；

2. 蛋白組 + 大分子生物藥為主 → 必選 HF；

3. 經費卡在中間，既要小分子又要深度蛋白：

• 若以蛋白為主：咬牙上 HF；

• 若小分子檢測占 70% 以上：Plus 搭配 Biopharma 高分辨選件，彌補大分子短板，但掃描速度仍不及原生 HF；

4. 升級路線：HF 后續可升級 HF-X 進一步提升靈敏度與掃描速度；Plus 無同檔升級通道。

五、一句話總結

• 常規小分子檢測、預算有限、低通量科研平臺 → Q Exactive Plus

• 深度蛋白組、單抗表征、DIA、高通量納流、復雜基質未知物定性 → Q Exactive HF